Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms