Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cnot11Q9CWN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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