Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms