Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms