Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard3bQ9CSB4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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