Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms