Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms