Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Mrpl20Q9CQL4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl20Q9CQL4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl20Q9CQL4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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