Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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