Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Commd4Q9CQ02 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms