Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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