Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms