Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms