Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms