Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem2Q99NH8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms