Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms