Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms