Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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