Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms