Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms