Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms