Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms