Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms