Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ciao1Q99KN2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms