Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab28Q99KL7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rab28Q99KL7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab28Q99KL7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab28Q99KL7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab28Q99KL7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab28Q99KL7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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