Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dok4Q99KE3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms