Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms