Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnip2Q99JG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnip2Q99JG7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms