Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psip1Q99JF8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psip1Q99JF8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms