Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms