Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms