Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms