Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1dQ99246 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms