Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms