Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo1Q924W9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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