Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms