Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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