Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms