Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms