Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atpaf2Q91YY4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms