Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lims2Q91XD2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms