Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NifkQ91VE6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms