Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn8Q91VA3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms