Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms