Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol9aQ8VDU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms