Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms