Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VDP2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VDP2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms