Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uhrf1Q8VDF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uhrf1Q8VDF2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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