Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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