Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms